프리랜서 3.3% 원천징수와 부가세 차이 정리

2026-09-16 · 프리랜서세금, 원천징수3.3%, 부가세계산법, 세금계산서, 부가세계산기

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결론부터: 100만원 계약, 원천징수면 967,000원 부가세 별도면 1,100,000원 입금

프리랜서로 일하며 “3.3% 공제 후 지급”과 “부가세 별도”라는 두 표현을 자주 만나지만, 이 둘은 완전히 다른 세금입니다. 용역비 100만원 계약을 예로 들면, 원천징수 3.3%를 적용받는 인적용역 소득자는 33,000원을 미리 떼이고 967,000원을 입금받습니다. 반대로 세금계산서를 발행하는 사업자가 부가세를 별도로 청구하면 공급가액 100만원에 부가세 10만원을 더한 110만원이 통장에 들어오지만, 이 중 10만원은 나중에 부가세로 납부해야 하는 돈입니다.

원천징수 3.3%란 무엇인가

원천징수 3.3%(소득세 3%+지방소득세 0.3%)는 회사가 프리랜서 등 인적용역을 제공하는 사업소득자에게 대가를 지급할 때, 소득세 일부를 미리 떼어 대신 납부하는 제도입니다. 이렇게 미리 낸 세금은 다음 해 5월 종합소득세 신고 때 실제 세액에서 빼주는 기납부세액으로 정산되며, 소득이 적어 실제 세액이 원천징수액보다 적으면 차액을 환급받을 수 있습니다.

부가가치세는 다른 세금입니다

부가가치세는 재화나 용역을 공급할 때 그 가격에 별도로 붙는 세금(10%)으로, 소득에 매기는 원천징수세와는 성격이 다릅니다. 세금계산서를 발행하는 사업자는 공급가액에 부가세 10%를 더해 청구하고, 분기 또는 반기마다 신고·납부합니다. 다만 인적용역 사업소득자로 원천징수만 적용받는 경우 부가세 신고 의무가 없는 경우가 많고, 반대로 사업자등록을 하고 세금계산서를 발행하는 프리랜서(디자인, 마케팅, 컨설팅 사업자 등)는 원천징수 대신 부가세를 받는 구조가 일반적입니다. 본인이 어느 쪽에 해당하는지는 계약서 문구와 사업자등록 여부에 따라 다르므로, 확실하지 않다면 홈택스나 세무 대리인을 통해 확인하는 것이 안전합니다.

계약금액 100만원 기준 정산 방식 비교

표에서 보듯 같은 “100만원짜리 일”이라도 정산 방식에 따라 통장에 찍히는 숫자와 이후에 내야 할 세금이 완전히 다릅니다. 계약서에 “3.3% 원천징수”라고 적혀 있다면 실제 받는 돈은 계약금액보다 적고, “부가세 별도”라고 적혀 있다면 받는 돈은 더 많아 보이지만 그중 일부는 나중에 납부해야 할 돈이라는 점을 기억해야 합니다.

헷갈리지 않으려면

계약 전에는 반드시 계약서에 “원천징수 3.3% 공제 후 지급”인지 “부가세 별도”인지를 명확한 문구로 남겨야 합니다. 특히 사업자등록을 새로 하는 경우 일반과세자와 간이과세자는 부가세 계산 방식 자체가 다르므로, 홈택스에서 본인의 과세유형부터 먼저 확인해야 합니다. 공급가액과 부가세, 합계금액을 헷갈릴 때는 부가세 계산기에서 숫자를 넣어 바로 확인할 수 있습니다.

정리

원천징수 3.3%는 소득세를 미리 떼는 제도이고, 부가가치세는 재화·용역 공급에 별도로 붙는 세금입니다. 계약금액이 같아도 어떤 방식이 적용되는지에 따라 실제 입금액과 이후 처리해야 할 세금이 크게 달라지므로, 계약서 문구를 꼼꼼히 확인하는 것이 중요합니다. 본인 상황에 어떤 방식이 적용되는지 헷갈린다면 국세청 홈택스나 세무 대리인에게 확인하고, 계산이 필요할 때는 부가세 계산기를 활용해 보시기 바랍니다.

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